| 日付 | 出来事 |
| 1859/07/01 | 横浜港：開港 |
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| 1859/07/05 | (死去)カニャール・ド・ラ・トゥール（物理学者） |
| | [1777年03月31日生〜］(享年82)水の沸点を正確に測定した |
| 1859/07/08 | (死去)オスカル１世（スウェーデン・ノルウェー国王） |
| | [1799年07月04日生〜］(享年60) |
| 1859/08/18 | (死去)前田利保（大名・富山10代藩主） |
| | [1800年02月28日生〜］(享年59) |
| 1859/08/23 | イギリス商人グラバーが長崎大浦にグラバー商会を設立 |
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| 1859/09/07 | 安政の大獄／井伊直弼 |
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| 1859/09/20 | (死去)ヤーコプ・グリム（文献学者・童話収集）ドイツ |
| | [1785年01月04日生〜］(享年74)
※『グリム童話』グリム兄弟の兄 |
| 1859/09/23 | 宣教師ヘボンがアメリカより来日 |
| | 後にローマ字・ヘボン式を考案する |
| 1859/09/24 | (死去)佐藤一斉（儒者） |
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| 1859/10/07 | 安政の大獄 |
| | 橋本左内・頼三樹三郎、伝馬町で刑死 |
| 1859/10/07 | (死去)島津斉興（薩摩藩主）お由羅騒動 |
| | [1791年11月06日生〜］(享年69) |
| 1859/10/07 | (死去)橋本左内（福井藩主・蘭学者・幕末の志士） |
| | [1834年03月11日生〜］(享年25)※安政の大獄で斬首 |
| 1859/10/07 | (死去)頼三樹三郎（尊皇攘夷運動家志士）頼山陽の子 |
| | [1825年05月26日生〜］(享年34)※ 安政の大獄に連座し斬首 |
| 1859/10/09 | (死去)梅田雲浜（尊攘派の志士） |
| | [1815年06月07日生〜］(享年45) |
| 1859/10/17 | 江戸城本丸炎上 |
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| 1859/10/19 | (死去)佐藤一斎（儒学者） |
| | [1772年10月21日生〜］(享年88) |
| 1859/10/22 | (死去)シュポーア（作曲家） |
| | [1784年04月05日生〜］(享年75) |
| 1859/10/27 | 吉田松陰が小塚原で処刑／享年30（安政の大獄） |
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| 1859/10/27 | (死去)吉田松陰（兵学家・教育者） 安政の大獄で処刑 |
| | [1830年08月04日生〜］(享年29) |
| 1859/11/21 | 吉田松陰：斬罪（安政の大獄第三次断罪）長州藩士で尊攘派の志士 |
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